MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid A

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010539	T	7	7	3624	3630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010539	CTG	2	6	3656	3661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010539	TTA	2	6	3709	3714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010539	CTA	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010539	T	6	6	3807	3812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010539	TGT	3	9	3821	3829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010539	CTT	2	6	3910	3915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010539	TTC	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010539	T	6	6	3922	3927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010539	CTG	2	6	3942	3947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010539	CTA	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010539	GAC	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010539	ATG	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010539	A	6	6	4117	4122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010539	T	6	6	4175	4180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010539	T	6	6	4197	4202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010539	GC	3	6	4203	4208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010539	A	6	6	4302	4307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010539	CCT	2	6	4338	4343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010539	AG	3	6	4354	4359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010539	CGTC	2	8	4387	4394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010539	TGAA	2	8	4455	4462	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010539	TACT	2	8	4930	4937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010539	TAAT	2	8	4974	4981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010539	TAC	2	6	4986	4991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010539	TCA	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010539	TAAG	2	8	5050	5057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010539	ATA	2	6	6070	6075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010539	ATAAA	2	10	6789	6798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010539	AAG	2	6	6811	6816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010539	CAG	2	6	7053	7058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010539	TAT	2	6	7545	7550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010539	CGGAG	2	10	8334	8343	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010539	G	6	6	10321	10326	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010539	TGT	2	6	11228	11233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010539	T	7	7	11321	11327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010539	TTAA	2	8	12079	12086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010539	AATT	2	8	12091	12098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010539	AATTC	2	10	12108	12117	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010539	AGG	2	6	12162	12167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010539	A	6	6	12173	12178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010539	TA	3	6	12193	12198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010539	TAA	2	6	12201	12206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010539	CGCT	2	8	14611	14618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010539	AAT	2	6	26745	26750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010539	TGAAA	2	10	27640	27649	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010539	TAA	2	6	28258	28263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010539	TGA	2	6	28903	28908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010539	A	6	6	28928	28933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010539	TGAGA	2	10	30832	30841	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010539	ACA	2	6	30889	30894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010539	AAT	2	6	35127	35132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010539	CTT	2	6	35155	35160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010539	ATCT	2	8	35213	35220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010539	TGAA	2	8	35237	35244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010539	ATT	2	6	36466	36471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010539	AAT	2	6	36527	36532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010539	A	6	6	36883	36888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010539	ATTA	2	8	36890	36897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010539	A	6	6	37342	37347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010539	AAC	2	6	37354	37359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010539	ATCA	2	8	37365	37372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010539	ATA	2	6	37382	37387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010539	ATTA	2	8	38349	38356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010539	TGAT	2	8	38413	38420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010539	AGGTC	2	10	38454	38463	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010539	CCT	2	6	38528	38533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010539	T	6	6	38564	38569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010539	T	6	6	38599	38604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010539	TGA	2	6	38691	38696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010539	GAA	2	6	38728	38733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010539	CAA	2	6	38816	38821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010539	TCG	2	6	38822	38827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010539	TTGT	2	8	38901	38908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010539	TAAG	2	8	38959	38966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010539	ATA	2	6	39027	39032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010539	GC	3	6	39106	39111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010539	TGCG	2	8	39160	39167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010539	AGT	2	6	39178	39183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010539	CA	3	6	39207	39212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010539	TGCT	2	8	39219	39226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010539	GAA	2	6	39256	39261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010539	GTA	2	6	39312	39317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010539	GTA	2	6	39323	39328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.